Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Nicotiana tabacum var. TN90) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID	lcl\|NW_015804060.1_cds_XP_016487290.1_7767
CDS Infomation	[gene=LOC107807432] [db_xref=GeneID:107807432] [protein=phytochrome C-like] [protein_id=XP_016487290.1] [location=join(5052..7092,7845..8661,9726..10022,11532..11742)] [gbkey=CDS]
Sequence	ATGTCTTCTAAATCTACAACAAGCAAGACTAATTGCTCTAGGAGCAGTTCAGCTAGGTCT AGGCATGGTGCTCGTGTTGTTGCTCAAACCCCAATTGATGCAAAACTCCACATGGAGTTT GAAGAGTCTGAACAACAATTTGATTACTCTAATTCAGTTAACTTGTCAAATTCCACTAGC AATGTTCCATCTTCAACTGTATCTGCTTATCTTCAGAAAATGCAAAGGGGAAGTCTAATT CAGCCATTTGGCTGTATGATTACTATTGATGAGCAGAACTTTACTGTCATTGCTTATAGC GAAAACGCACCAGAAATGTTGGACTTGATACCTCATGCTGTTCCGAGCATCGAAATGCTA GAGGCTTTGACCTTTGGAACTGATGTCAGGACACTTTTTCGATCTTCAGGTGCTTCCGCG CTTGAAAAAGCAGCTAGCTTTGGAGAACTTAGTTTGCTTAATCCTATTTTGGTTCATTGT AGAAACTCGGGTAAGCCTTTCTATGCGATTTTACACCGCATTGATGTTGGGTTAGTAATA GATTTGGAGGCTGTGAATCCAGATGATGTCCCTGTAACTGCAGCTGGAGCATTAAAATCT TATAAGCTAGCTGCTAAAGCTATTGCAAAATTACAATCTCTGCCAAGTGGGGATATATCA TTGCTATGTGATGTATTAGTTAGAGAAGTGAGTCATTTGACGGGCTATGATCGTGTTATG GTTTATAAATTCCACGAGGATGAACATGGGGAAGTTATTGCAGAATGTCGTAAGCGTGAA CTAGAACCTTATCTTGGCTTGCATTACCCTGCTACCGATATACCACAAGCTTCGAGATTT CTCTTCATGAAGAATAAGGTTCGGATGATATGCGATTGCTTAGCTCCACCAATTAGGGTG ATTCAGGACCCGAGACTGGCTCAGCCACTGAGCCTTGGTGGATCCGCATTAAGAGCTCCC CACGGCTGTCATGCACAATACATGGCCAATATGGGTTCTATTGCATCTATGGTCATGTCG GTGTTGATTAGTGAGGAAGATGACGAGTTGGATAGTGACCAGCAAATGGGAAGAAAATTG TGGGGTTTGGTCGTTTGCCATCACACTTGCCCTAGATTTCTTCCTTTTCCGTTGAGGTAC GCATGTGAGTTCTTGGTTCAAGTTTTCAGTGTTCAGATCAATAAGGAAGTGGAAGTGGCA GCTCAACTTAGGGAAAAGCATATACTGCGAACTCAGACTGTTCTTTGTGACATGCTTCTA AGAGATGCCCCCTTGGGAATCGTTAACCAGTCTCCTAATGTTATGGACCTTGTAAGGTGT GACGGGGCTGCACTTTACTATAGGAACAAACTTTGGTTGCTTGGTGTTACGCCAACGGAG TCCCAAATTAGAGATATAGCTGAATGGCTTAATGAATCTCACGGTAGTAGTACAGGTTTA AGCACTGATAGCCTCATGGAAGCTGGCTACCCATGTGCTGCTGTGCTCGGCGATGCGGTG TGTGGAATGGCTGTTGTAAAAATAACTTCAAAAGATTTTCTCTTCTGGTTCCGCTCCCAC ACAGCTAAAGAGATCAAGTGGGGTGGTGAAAAACATGATCCCGGAGACAAGGATGACGGA AGAAAGATGCACCCAAGGTCATCATTTAAAGCCTTTTTGGAGGTTGTTAAGCGGCGGAGC GTACCTTGGGAGGATGTGGAAATGGATGCAATCCATTCCTTGCAGCTGATATTGCGAGGA TCTTTGCAAGATGAGGTTGCTGATTGTTCTAAAATGATTGTGAATGTCCCTGCTGCAGAT ACCAGTATAGAGAGAGTGGATGAACTTCGTATTGTCACAAACGAAATGGTTCGTCTTATT GAGACAGCATCAATACCCATTTTGGCAGTTGATGCTTCAGGCCGTATTAATGGATGGAAC TCGAAAATTTCTGAGTTAACTGGATTGCTTATAGAGAAAGCAATAGGCGTACCATTGGTC AATTTGGTTATTGAAGATGGAGCAAGCACAATTGAAGGTGTTCTCTCCCTGGCTTTGCAA GGCAAGGAGGAGAAAAATGTAGAAATCAAACTTAGGACATTTGGTCGCCAAGAAAATGTC GGACCAATTACGTTAGTGGCTAATGCCTGCTGTAGTCGAGACATAAAACAAAATATTGTT GGAGTTTGCTTTATCGGGCAAGATGTTACTGGGTTAAAACTGATTGAGGACAAATATAGC CACATTGAAGGTGATTATGTTGGAATTGTCCGCAACCCATCTCCTCTAATTCCTCCAATT TTTGTGATGGATGAACATGGAAGATGCATGGAATGGAACGAGGCTATGCACAAATTGACT GGGTTGAAGAGGGAGGAGGTCATTGATCAAATGCTTCTTGGTGAGGTTTTCACAGTCAAT AACTTCGGTTGCAGGGTGAAAGATGGAGACACACTAATCAAGCTCAGGATATTATTTAAT AGGGTAATTGCTGGCGGGGAAGGTGAGAAATTGTTTTTGGGGTTATTTGATAAACAGGGT AAGTATATTGAAGCCTTAATATCTGCAAATAAAAGGATTGATGCCGATGGTAGGGTAACT GGGGTCTTGTGCTTCCTGCATATTCCTAGTCCAGAACTTCAATATGCACTGCATGTGCAG AAGATGTCAGAACAAGCTGCTGAAAGTAGTCTAAATAAGTTGGCTTATGTTCGTCTTGAA CTAAAAAACCCTTTAAATGGGATAAAGTGCATTCAGAATCTGATGAAATCTTCTGATTTA AGCAATGATCAAAGTCATTTGCTGAAGACAAGCACAATGTGTCAAGAACAACTAGCCAAG ATCATTGATGACACTGATATTGATAGCATCGAGGAATGCTATATGGAAATGAACTCTTCT GAGTTCAATCTTGGCGAAGTTGTTACAGTGGTCATCAATCAAGTTATGATTCTAAGTCAG GAGCGCAAGGTTCAGGTCACATGCGATTCACCTGTCGAACTATCACACTTGTACCTGATT GGTGACAGTTTGAGGCTTCAACAAGTCCTTTCTGACTTTTTGACCACAGCTATCCTTTTT ACTGTTCCTTTTGAAGGTTCCTCTGTGGTGCTCAGAGTAATTCCAAGAAAGGAACGTATA GGGACCAAGATGCACGTCATGCATCTTGAATTCCGAATCACTCATCCAGCCCCAGACGTA CCTGAAGAGCTAATTCAACAGATGTTCTACTACAGTCAGAGTATATCAAGGGAAGGTCTT GGCCTATACATCAGCCAGAAACTTGTTAAAATCATGAATGGAACCGTCCAGTATCTTCGG GAGGCGGAGAGATCCTCATTCATTATCTTAGTTGAATTTCCACTGACAGACCAGAGAAAC CACTAG

Peptide Sequence

PEP ID	XP_016487290.1
PEP Infomation	PREDICTED: phytochrome C-like [Nicotiana tabacum]
Sequence	MSSKSTTSKTNCSRSSSARSRHGARVVAQTPIDAKLHMEFEESEQQFDYSNSVNLSNSTS NVPSSTVSAYLQKMQRGSLIQPFGCMITIDEQNFTVIAYSENAPEMLDLIPHAVPSIEML EALTFGTDVRTLFRSSGASALEKAASFGELSLLNPILVHCRNSGKPFYAILHRIDVGLVI DLEAVNPDDVPVTAAGALKSYKLAAKAIAKLQSLPSGDISLLCDVLVREVSHLTGYDRVM VYKFHEDEHGEVIAECRKRELEPYLGLHYPATDIPQASRFLFMKNKVRMICDCLAPPIRV IQDPRLAQPLSLGGSALRAPHGCHAQYMANMGSIASMVMSVLISEEDDELDSDQQMGRKL WGLVVCHHTCPRFLPFPLRYACEFLVQVFSVQINKEVEVAAQLREKHILRTQTVLCDMLL RDAPLGIVNQSPNVMDLVRCDGAALYYRNKLWLLGVTPTESQIRDIAEWLNESHGSSTGL STDSLMEAGYPCAAVLGDAVCGMAVVKITSKDFLFWFRSHTAKEIKWGGEKHDPGDKDDG RKMHPRSSFKAFLEVVKRRSVPWEDVEMDAIHSLQLILRGSLQDEVADCSKMIVNVPAAD TSIERVDELRIVTNEMVRLIETASIPILAVDASGRINGWNSKISELTGLLIEKAIGVPLV NLVIEDGASTIEGVLSLALQGKEEKNVEIKLRTFGRQENVGPITLVANACCSRDIKQNIV GVCFIGQDVTGLKLIEDKYSHIEGDYVGIVRNPSPLIPPIFVMDEHGRCMEWNEAMHKLT GLKREEVIDQMLLGEVFTVNNFGCRVKDGDTLIKLRILFNRVIAGGEGEKLFLGLFDKQG KYIEALISANKRIDADGRVTGVLCFLHIPSPELQYALHVQKMSEQAAESSLNKLAYVRLE LKNPLNGIKCIQNLMKSSDLSNDQSHLLKTSTMCQEQLAKIIDDTDIDSIEECYMEMNSS EFNLGEVVTVVINQVMILSQERKVQVTCDSPVELSHLYLIGDSLRLQQVLSDFLTTAILF TVPFEGSSVVLRVIPRKERIGTKMHVMHLEFRITHPAPDVPEELIQQMFYYSQSISREGL GLYISQKLVKIMNGTVQYLREAERSSFIILVEFPLTDQRNH

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.